生物安全柜是為操作原代培養(yǎng)物、菌毒株以及診斷性標本等具有感染性的實驗材料時，用來保護操作者本人、實驗室環(huán)境以及實驗材料，使其避免暴露于上述操作過程中可能產(chǎn)生的感染性氣溶膠和濺出物而設(shè)計的。

一級生物安全柜可保護工作人員和環(huán)境而不保護樣品。氣流原理和實驗室通風櫥一樣，不同之處在于排氣口安裝有HEPA過濾器。所有類型的生物安全柜都在排氣和進氣口使用HEPA過濾器。一級本身無風機，依賴外接通風管中的風機帶動氣流，由于不能對試驗品或產(chǎn)品提供保護，目前已較少使用。

二級是目前應(yīng)用的柜型。與Ⅰ級一樣，Ⅱ級也有氣流流入前窗開口，被稱作“進氣流"，用來防止在微生物操作時可能生成的氣溶膠從前窗逃逸。與Ⅰ級不同的是，未經(jīng)過濾的進氣流會在到達工作區(qū)域前被進風格柵俘獲，因此試驗品不會受到外界空氣的污染。 Ⅱ級的一個*之處在于經(jīng)過HEPA過濾器過濾的垂直層流氣流從安全柜頂部吹下，被稱作“下沉氣流"。下沉氣流不斷吹過安全柜工作區(qū)域，以保護柜中的試驗品不被外界塵埃或細菌污染。